Nel 1202 scoppiarono parecchie  guerre in Italia, e avvenne anche la guerra tra Assisi e Perugia. Francesco sentì il richiamo di  questa nuova avventura .  Per il giovane Bernardone   questa occasione era molto importante per la sua vita : diventare cavaliere. Durante la battaglia Francesco venne fatto prigioniero. In questo periodo angusto e in precarietà venne rilasciato. Ma la prigionia al ragazzo donò una brutta malattia .  Nel  periodo in cui  Francesco recuperò la salute senti che c’era in Assisi, un cavaliere di nome Gualtiero de Brienne  che cercava nuovi compagni d’avventura ,Francesco prese al volo questa occasione e volle andare con lui in guerra verso la  Puglia per seguire sempre il suo sogno. Mentre si trovò a Spoleto si ammalò. Una febbre altissima lo costrinse a letto. Nella notte  in sogno Francesco  udì una voce che gli disse: Dove voi andare Francesco figlio mio? 
Rispose  - Nelle   Puglie a fare il cavaliere?  Continuò – Dimmi Francesco per te conta di più il servo o il padrone?
Rispose – Il padrone .   Poi la voce gli disse ,allora perché mi abbandoni figlio mio? Francesco all’udire questa frase capi  che quella voce era  del Signore. Francesco gli disse ,dimmi quello che io faccia per te,mio Dio? E lui rispose-Vai a  casa io ti dirò, poi cosa devi fare .   Era il 1205

Durante il suo cammino,dal viaggio di ritorno da Roma , incontrò un’ uomo affetto da lebbra, all’epoca diffusissima. Chiunque nei suoi panni avrebbe cambiato addirittura strada, ma lui abbraccio e baciò il lebbroso, come conferma agl’insegnamenti di Dio.  Da questa esperienza Francesco si avvicinerà definitivamente alla chiesa di S. Damiano in Assisi.